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本文標題:"生物物種水平分化通常相似為97%-微生物鑒定"

新聞來源:未知 發布時間:2018-5-3 16:39:22 本站主頁地址:http://www.027toilet.cn

生物物種水平分化通常相似為97%-微生物鑒定

  非培養的生物學方法

  雖然最初廣泛應用非培養的磷脂脂肪酸法(PLFA)來分析環境中的菌
群類型,但如今DNA和RNA測序方法更加廣泛地應用于微生物鑒定和它們
的系統發育樹研究。這些方法已經用于定位和定量分析分離出的環境中
的微生物,甚至是那些能夠在環境中增殖但未被實驗室分離培養的微生
物。
  微生物的16S rRNA序列不僅具有高度保守的核苷酸序列,而且序列
的多樣性提供了區分細菌、古菌和真核生物之間差異的方法。基于上述
多樣性的水平、系統發育、基因組和物種水平上也會有差別(Ward等,1
992)。實際上,生物物種水平的分化通常相似性為97%;這是整個基因
組DNA—DNA雜交結果與16S rRNA序列相近呈現弱相關性的基礎(Stackeb
randt和Goebel,1994)。在整個基因組的雜交中,16S rRNA序列大于70
%而小于97%的鏈相近即被認為是同種屬的一部分。由于任何新生物的
16S rRNA序列一旦發現就會進入數據庫,可以將新分離到的16S rRNA序
列在數據庫中進行比較來確定是否已被精確報道,并鑒定親緣關系。雖
然16S rRNA序列已被證明為可靠的系統發育標記,但還是推薦讀者了解
一下Olsen和Woese寫的關于高分子對比系統發育重要性的綜述,既可作
為檢測分子系統發育總的可靠性方法,也可作為更廣泛基因組發育史的

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