真菌多樣性

真菌（fungi）菌體微小，不具有葉綠素（chlorophyll）及維管束，通常要以顯微鏡加以觀察，

但是也有個(gè)體較大者，
例如洋菇（Agaricus bisporus）、靈芝（Ganoderma lucidum）等菇類(lèi)，均可以肉眼直接觀察。現(xiàn)在所知約100,000 種真菌中，大部分是腐生性（saprophytic），可進(jìn)一步區(qū)分為土壤腐生菌、木腐菌、落葉及腐草生菌、糞生菌等生態(tài)類(lèi)型。有些是共生性（symbiotic），如地衣（lichens）、菌根菌（mycorrhizal fungi）、昆蟲(chóng)共生菌和真菌共生菌等。有些種類(lèi)引起人類(lèi)疾病，有些會(huì)造成畜病，大都為皮膚或肢體（appendages）的表淺性疾病（superficial disease）病征，但近年來(lái)全身性黴菌感染增加，尤其是免疫功能受損的病患，例如接受化學(xué)治療的癌癥病人，或是接受器官與骨髓移植的病人，感染全身性黴菌的機(jī)率高，且黴菌感染導(dǎo)致的死亡率亦高。此外，
約有8,000 種真菌引起100,000 種植物病害。

Agrios (2005）對(duì)植物病原真菌之分類(lèi)方式，先區(qū)分為一、偽真菌（Fungallike Organisms or Pseudofungi），包括二界，原生動(dòng)物界（The kingdom Protozoa）包括二門(mén)（phyla）：粘菌門(mén)（Myxomycota）及寄生粘菌門(mén)（Plasmodiophoromycota）；原藻界（The kingdom Chromista）或稱(chēng)為原生藻菌界（The kingdom Stramenopila）包括卵菌門(mén)（Oomycota）。二、真菌（The True Fungi）為真菌界（The kingdom Fungi） 包括四門(mén)：瓶菌門(mén)（Chytridiomycota）、結(jié)合菌門(mén)（Zygomycota）、子囊菌門(mén)（Ascomycota，包含不完全菌綱("Deuteromycetes")或稱(chēng)為有絲分裂孢子群(mitosporic fungi)）、擔(dān)子菌門(mén)（Basidiomycota)。由于知識(shí)的累積，各真菌種類(lèi)的歸類(lèi)亦常有變動(dòng)。在廣義上被稱(chēng)為真菌的幾類(lèi)生物體，有真菌界（Fungi, 可能源自于領(lǐng)鞭蟲(chóng)(choanoflagellate ancestor) ）：瓶菌門(mén)（壺菌門(mén)）、結(jié)合菌門(mén)（接合菌門(mén)）、Glomeromycota（聚合菌門(mén)、球囊黴菌門(mén)）、子囊菌門(mén)及擔(dān)子菌門(mén)。金黃藻菌鞭毛菌界（Kingdom Stramenopila, 可能源自于金黃藻、矽藻等原生生物(protist) ）：卵菌門(mén)、Hyphochytridiomycota（前毛壺菌門(mén)、絲壺菌門(mén)）及Labyrinthulomycota（迷宮黏菌門(mén)、網(wǎng)黏菌門(mén)）。不確定的類(lèi)似真菌生物（Fungus-Like Organisms of Uncertain Affinity）：Myxomycota（plasmodial slime moulds, 黏菌門(mén)）、Plasmodiophoromycota（plasmodiophorids, 內(nèi)部寄生性黏菌門(mén)、根腫菌門(mén)）、Dictyosteliomycota（dictyostelid slime moulds, 網(wǎng)柱粘菌門(mén)）及Acrasiomycota（acrasid slime moulds, 聚孢黏菌門(mén)、集孢黏菌門(mén)）。